Notre laboratoire de phylogénie et génétique moléculaire – un des premiers à voir le jour dans une institution botanique – développe et applique des approches génomiques au service d’une meilleure connaissance et conservation de la biodiversité. Il constitue un outil essentiel pour soutenir nos recherches, visant à mieux comprendre l’évolution des plantes et des champignons, à améliorer la classification du vivant, mais aussi à quantifier la diversité génétique des populations d’une même espèce.
Le laboratoire contribue également à la formation académique et professionnelle (CFC): il accueille des étudiantes et étudiants de master, doctorat et postdoctorat de l’Université de Genève, ainsi que d’autres institutions suisses ou internationales, et participe à la formation d’apprenties et apprentis laborantins en biologie.
Grâce à la combinaison d’outils moléculaires de pointe et d’une expertise botanique reconnue, le PhyloLab joue un rôle central dans le développement de la recherche en systématique, taxonomie et génétique de la conservation.
« Le PhyloLab constitue une infrastructure stratégique pour le Jardin Botanique de Genève. En combinant outils génomiques de pointe et expertise botanique, il renforce notre capacité à produire des connaissances de référence, à soutenir notre recherche et à fournir des bases scientifiques essentielles à la conservation de la diversité végétale et fongique.»
Mathieu Perret, Conservateur
Techniques utilisées
- Extraction d’ADN à partir de matériel frais ou historique, prélevé sur des échantillons d’herbier
- Préparation de librairies génomiques et capture de gènes par sondes ARN
- Préparation de librairies génomiques ciblées par digestions enzymatiques (ddRADseq)
- Séquençage massif de l’ADN ou séquençage dit de nouvelle génération (NGS)
- Amplification par PCR et séquençage d’ADN Sanger
- Mise au point de marqueurs microsatellites et génotypages
- Clonage de fragments d’ADN
- Analyse de fragments d’ADN (microsatellites, AFLP, SNP).