Extraction d'ADN dans le laboratoire de phylogénie et génétique moléculaire

Le PhyloLab

Notre laboratoire de phylogénie et génétique moléculaire explore les mécanismes évolutifs qui façonnent la diversité des plantes et des champignons et décrypte l’histoire du vivant pour mieux guider sa classification et sa conservation.

Notre laboratoire de phylogénie et génétique moléculaire – un des premiers à voir le jour dans une institution botanique – développe et applique des approches génomiques au service d’une meilleure connaissance et conservation de la biodiversité. Il constitue un outil essentiel pour soutenir nos recherches, visant à mieux comprendre l’évolution des plantes et des champignons, à améliorer la classification du vivant, mais aussi à quantifier la diversité génétique des populations d’une même espèce.

Le laboratoire contribue également à la formation académique et professionnelle (CFC): il accueille des étudiantes et étudiants de master, doctorat et postdoctorat de l’Université de Genève, ainsi que d’autres institutions suisses ou internationales, et participe à la formation d’apprenties et apprentis laborantins en biologie.

Grâce à la combinaison d’outils moléculaires de pointe et d’une expertise botanique reconnue, le PhyloLab joue un rôle central dans le développement de la recherche en systématique, taxonomie et génétique de la conservation.

« Le PhyloLab constitue une infrastructure stratégique pour le Jardin Botanique de Genève. En combinant outils génomiques de pointe et expertise botanique, il renforce notre capacité à produire des connaissances de référence, à soutenir notre recherche et à fournir des bases scientifiques essentielles à la conservation de la diversité végétale et fongique.»

 

Mathieu Perret, Conservateur

Processus d'extraction d'ADN dans le laboratoire de phylogénie et génétique moléculaire (le PhyloLab) du Jardin Botanique de Genève
Extraction d'ADN

Techniques utilisées

Préparation d'un tissus afin d'en extraire l'ADN dans le laboratoire de phylogénie et génétique moléculaire (le PhyloLab) du Jardin Botanique de Genève
Extraction d'ADN
  • Extraction d’ADN à partir de matériel frais ou historique, prélevé sur des échantillons d’herbier
  • Préparation de librairies génomiques et capture de gènes par sondes ARN
  • Préparation de librairies génomiques ciblées par digestions enzymatiques (ddRADseq)
  • Séquençage massif de l’ADN ou séquençage dit de nouvelle génération (NGS)
  • Amplification par PCR et séquençage d’ADN Sanger
  • Mise au point de marqueurs microsatellites et génotypages
  • Clonage de fragments d’ADN
  • Analyse de fragments d’ADN (microsatellites, AFLP, SNP).

 

Pour aller plus loin

La science
Photographie au microscope de Cribaria macrocarpa ressemblant à de petites boules duveteuses sur une fine tige et déposées sur un morceau d'écorce brune
Les Cribrariaceae
La science
Gros plan d'une fleur ressemblant à une gueule-de-loup, prise de profil, de couleur vert vlair et couverte de petits points bordeaux
Les Gesneriaceae
La science
Mimusops sambiranensis, arbre de la famille des Sapotacées, vu du sol avec un immense tronc et de grandes feuilles en pleine forêt tropicale, et le ciel dans le coin à gauche
Les Sapotaceae
La science
Ancienne moraine latérale du glacier du Rhône, dans la partie haute de la plaine alluviale de Gletschbode (Valais), couverte par une saulaie et une aulnaie formées probablement avant ou dès le retrait du glacier (vers 1850). La présence d’individus âgés de Paysage alpin avec des saulaie et aulnaie au premier plan et une morraine glaciaire partiellement recouverte au second plan
Salix